“六根清净”这个名词，在一般不知佛法的人看来，是非常浮浅的，甚至非常好笑的。他们以为凡是出了家的僧尼，一定就是六根清净的人，如果稍微沾染了一点男女钱财的习气，一些专门喜欢扬恶隐善的新闻记者便会在报纸上大做他们“六根不净”的渲染文章!至于什么叫做六根，甚么又叫做六根清净?他们是不想知道的。其实，“六根清净”四个字中大有道理。

六根，是指生理学的全部范围。佛教看宇宙人生，既不是唯物论者，也不是唯心论者，更不是唯神论者，乃是主张因缘和合的缘生论者。所以，佛教看一个人的构成，是从心理、生理、物理的三方面来分析的。上面所说的六根是属于生理学，加上六尘的物理学及六识的心理学，便是一个人的总和，六根、六尘、六识的形成称为十八界，十八界的三大类构成鼎足之势，相互为用，缺了一类，其他的二类也就不能存在。因为六尘与六识要靠六根的媒介才有作用，六尘与六根要靠六识的判别才有价值，六根与六识要有六尘的反映才有功效。如果要下一个比喻，那么，六根是镜子，六尘是被镜子所照的影像，六识是判别镜中所照影像的人。

六根是六识的工具，作善作恶固然是出于六识的主张，造成善恶行为的事实却是在于六根的作用。人之流转于生死轮回的苦海之中，就是由于六根不曾清净，自从无始以来的一切罪业均由六根所造，比如眼根贪色、耳根贪声、鼻根贪香、舌根贪味、身根贪细滑、意根贪乐境;有贪，也必有嗔，贪与嗔是由无明──烦恼而来，合起来就是“贪、嗔、痴”的三毒交加，恶多善少，永无出离生死苦海的日子了。

修持解脱道的工夫，不外戒、定、慧的三学，但是慧的主要根源是戒与定，所以修持的入门工夫应从身心的两方面着手：一是修身，一是修心。把不好的念头修理掉，称为修心，修心的主要工夫是禅定;把不好的行为修理掉，称为修身，所以修身也可称为修行，修身的主要工夫是持戒。持戒的目的是在守护根门──守卫保护住六根的大门，不让坏事从六个根门之中溜进我们的心田，以致种下生死流转的祸苗。因为，一个凡夫，除了进入禅定的境界而外，就不能没有妄想，妄想是促成六根造业的导火线，佛教的戒律就是妄想与六根之间的保险丝或灭火器，在戒律的防卫之下六根才能渐渐地清净，一旦到了六根清净的程度，超凡入圣的境界也就快要接近了。